En raison des exigences de la microscopie, les options de préparation des échantillons sont limitées aux : Montages entiers, où un organisme ou une structure entière est suffisamment petit ou suffisamment fin pour être placé directement sur une lame de microscope (par exemple, un petit organisme unicellulaire ou multicellulaire ou une membrane). qui peuvent être étirées finement sur une lame) Préparations de type « écrasement », où les cellules sont intentionnellement écrasées ou écrasées sur une lame pour révéler leur contenu (par exemple, des spécimens botaniques où les cellules sont perturbées pour révéler des chromosomes) Frottis, où le spécimen est constitué de cellules en suspension dans un liquide (par exemple, sang, sperme, liquide céphalo-rachidien ou culture de micro-organismes), ou lorsque des cellules individuelles ont été grattées, brossées ou aspirées (aspirées) d'une surface ou de l'intérieur d'un organe (cytologie exfoliative) .Les frottis constituent la base du célèbre « test Pap » utilisé pour dépister le cancer du col de l'utérus chez les femmes. Sections dans lesquelles les échantillons sont soutenus d'une manière ou d'une autre afin de pouvoir en couper des tranches très fines, les monter sur des lames et coloré.Les coupes sont préparées à l'aide d'un instrument appelé « microtome ». Parmi ces options, seules les montures entières et les coupes préservent les relations structurelles entre les cellules individuelles et les composants extracellulaires.Les frottis et les préparations de courges fournissent des détails sur les cellules individuelles et leur nombre relatif, mais les relations structurelles sont perdues.La préparation des coupes est la plus complexe de ces méthodes techniquement car elle nécessite un équipement spécialisé et une expertise considérable.L'examen microscopique des coupes par un pathologiste constitue la pierre angulaire du diagnostic du cancer.Bien que la méthodologie de préparation de coupes à partir de matériel animal et végétal soit similaire, la description suivante concerne les tissus animaux (humains).
